1874年，同治十三年

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左宗棠沒有進入新疆，坐鎮甘肅，淘汰陝甘駐防軍，將營改為旗，以節約糧餉。他下令成立甘肅織呢總局和甘肅製造局，以及蘭州火藥局等機構，為後世發展西部工業打下了基礎。

這時日本人侵犯澎湖列島，李鴻章上奏，請調駐紮陝西的劉銘傳所部趕赴山東，計劃渡海增援台灣。左宗棠擔心陝西邠州和乾州兵力空虛，要求穆圖善從涇州的駐軍中撥出五營接手乾州的防務。

對於海上的侵略者而言，到這時為止，清